В 1679 году на площади напротив парадных въездных ворот с восточной стороны Государева двора был возведен собор Покрова Пресвятой Богородицы. До этого здесь располагалась деревянная церковь. Ее построили еще при боярине Иване Никитиче Романове в память победы над польскими интервентами.

По указу царя Алексея Михайловича Романова в 1671 году было начато строительство собора. А окончено в 1679 году царем Фёдором Алексеевичем Романовым. В 1680 году 1 октября храм был освящен патриархом Иоакимом в честь праздника Покрова Богородицы.

Строительством собора руководил знаменитый зодчий XVII века московский подмастерье каменных дел Иван Кузнечик. Золотистые, красные, синие и зелёные изразцы сплошь покрывают верх фасадов храма и широкие фризы барабанов глав, создавая завораживающее впечатление. Ранее все пять куполов были позолочены. В соборе стояла икона праздника Покрова Богородицы, изготовленная по росту семилетнего царевича Петра Алексеевича.

В 1812 году собор был разорен французами. Так же в 17 веке в Измайлово устраивали театральные представления. Измайлово связано с именем Петра I. Здесь он неоднократно бывал в детские и юношеские годы. В мае 1688 года Петр I нашёл в амбаре старого Льняного двора английский ботик, построенный корабельным мастером Брантом, которому суждено было стать «дедушкой русского флота».